Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm29394H3BIW7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm29394H3BIW7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms