Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf4bG5E8Z2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf4bG5E8Z2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf4bG5E8Z2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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