Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms