Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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