Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm5861F6VCN9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gm5861F6VCN9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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