Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20671F6TVX7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20671F6TVX7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms