Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngap1F6SEU4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms