Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms