Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85cE9Q6B2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms