Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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