Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms