Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scaf11E9PZM7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf11E9PZM7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms