Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms