Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms