Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms