Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms