Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms