Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms