Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms