Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms