Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AU015836B2RUM3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms