Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apba1B2RUJ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms