Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apol7aB2RT54 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms