Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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