Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms