Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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