Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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