Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cavin4A2AMM0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms