Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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