Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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