Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms