Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd2V9GX34 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd2V9GX34 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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