Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Top3bQ9Z321 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms