Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CcniQ9Z2V9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms