Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Crlf3Q9Z2L7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Crlf3Q9Z2L7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Crlf3Q9Z2L7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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