Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uso1Q9Z1Z0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms