Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms