Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chst4Q9R1I1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms