Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek3Q9R0A5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms