Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms