Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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