Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp21Q9QZL6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms