Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms