Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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