Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms