Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms