Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rad18Q9QXK2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Rad18Q9QXK2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rad18Q9QXK2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms