Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Limd1Q9QXD8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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