Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc5Q9QX29 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms