Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms